公司调整管理机构的通知文件应该通过电子邮件进行发送。在邮件中，应该说明该通知的重要性以及对组织的影响。同时，应该明确新的管理机构的组成以及各个成员的责任和职责。
最后，应该强调员工和管理层之间的合作和沟通，以确保公司的顺利运营。
根据中国的相关法规，公司调整员工社保基数需要重新签订劳动合同。因为社保基数作为劳动合同的一部分，公司对员工的社保基数进行调整属于合同内容的变更。为了保障员工的权益，公司需要在调整社保基数后与员工重新签订劳动合同，明确新的社保基数及相关福利待遇。这样可以确保公司和员工的权益，避免可能出现的纠纷和不必要的法律风险。
如果员工对公司的薪资结构调整提出了异议并且提出具体的理由和建议，那么不算是拒绝，而是一种反馈和建议。这样的反馈有助于公司更好地了解员工的需求和期望，进而调整薪资方案，提高员工的满意度，从而提高公司的绩效。