D3655次动车时刻表经过广州东的站点有:肇庆东站、广州站、东莞站、东莞南站、深圳北站、深圳坪山站、汕尾站、葵潭站、潮汕站。
途经21个站点,分别为:南宁站、南宁东站、来宾北站、柳州站、桂林北站、东安东站、永州站、祁阳站、衡阳东站、长沙南站、萍乡北站、宜春站、南昌西站、抚州东站、鹰潭北站、上饶站、武夷山站、南平市站、建瓯西站、延平站、福州站,全程历时10小时55分。
不到深圳北站,D3661是从北海始发,经南宁东、贵港、梧州南、佛山西、广州,终到深圳站(位于罗湖)的动车。因深圳站收发动车和绿皮车,一些动车就改在深圳站收发了。