一般认为108金刚菩提要使用特殊的绳子，这种绳子叫做“五色线”，由五彩的线缠绕编织而成。五色线的五种颜色分别代表着五种智慧，即无所障碍智、平等智、观察世间智、行愿智和法身智。
五色线不仅有寓意深刻的象征意义，而且富有弹性，不紧绷不松弛，非常适合编织佛珠。
此外，经过长时间的使用，五色线还能散发出特别的气味，从上至下引领着修行者通向佛国。因此，在使用108金刚菩提时，最好使用五色线这种特别制作的绳子，以充分体现其象征意义和使用效果。
通常来说金刚菩提每次泡水在1～2个小时左右为宜，这样能够软化里面的残渣污垢，也方便清理。不可添加各种的清洁剂，否则容易引起一定的腐蚀效果，同时不要长期泡水清洗，以免出现变色的现象。金刚菩提用水泡1～2个小时左右在清洗金刚菩提的时候，最好不要将其泡水过久，一般情况下每次泡水大概保持在1～2个小时左右为宜，主要以温水为主，如果泡水的时间过短，里面残留的一些果肉或者其它残渣不能充分软化，清理起来也比较麻烦。
同时将金刚菩提泡洗的过程中，不可在里面添加各种的化学清洁剂，由于它内部结构化学性质不稳定，这样容易造成一定的腐蚀效果，影响金刚表面的色泽，每次泡洗后要及时将其擦干，再放在阴凉处晾干。
在保养金刚菩提的时候，最好不要经常泡水清洗，由于它本身是一种植物的种子，长期泡水后容易出现变色的现象，同时表面潮湿容易出现霉变现象，在平时主要以干刷为主，这样能清理里面的污垢，还能形成一定的打磨效果。